本书分上中下三篇及附篇。上篇综述清及清以前历代本草概况和特点；中篇以朝代为序，收录清以前及清代本草重要典籍之考证，对每一名著，详细列述其命名、作者、成书、卷次、药数等项内容，并对书中所存在的争论性问题，详加讨论；下篇列举清以前及清代本草著作，对每一书名，注明作者、著作要点、成书年代等，并加以评价；附篇为《历代本草人物名录》，简要介绍历代本草学家及其学术传承。