《本草纲目》全书共52卷，分为16部、60类。收录原有诸家《本草》所载药物共1518种，新增药物374种。对每种药物，以“释名”确定名称；“集解”叙述产地、形态、栽培及采集方法等，“辩疑”、“正误”考订药物品种真伪和纠正历史文献记载的错误；“修治”说明炮炙方法；“气味”、“主治”、“发明”分析药物的性味与功能；“附方”搜集古代医家和民间流传的方剂共11000余首。并附有1100余幅药物的形态图。本书对了多种版本的《本草纲目》，以面向大从，经济实用为目的，以尽可能展示原着的全貌和完整为前的是，按照原书的编写体例进行了白话精译，并适当地删去了一些怪异难得的品物和一些缺乏科学依据的医方，以利于读者更好地掌握日常饮食养疗的知识。

   《“本草纲目”研究(套装上下册)》对了多种版本的《本草纲目》，以面向大从，经济实用为目的，以尽可能展示原着的全貌和完整为前的是，按照原书的编写体例进行了白话精译，并适当地删去了一些怪异难得的品物和一些缺乏科学依据的医方，以利于读者更好地掌握日常饮食养疗的知识。

本草纲目上
　本草纲目序（王世贞序）
　辑书姓氏
　　新附本草纲目江西版
　　　一、重刻本草纲目序（夏良心序）
　　　二、重刊本草纲目叙（张鼎思序）
　　　三、进本草纲目疏
　附图
　　新附江西版之附图
　总目
　凡例
　本草纲目序例第一卷
　　历代诸家本草
　　引据古今医家书目
　　引据古今经史百家书目
　　采集诸家本草药品总数
　　神农本经名例
　　陶隐居名医别录合药分剂法则
　　采药分六气岁物
　　七方
　　十剂
　　气味阴阳
　　五味宜忌
　　五味偏胜
　　标本阴阳
　　升降浮沉
　　四时用药例
　　五运六淫用药式
　　六腑六脏用药气味补泻
　　五脏五味补泻
　　脏腑虚实标本用药式
　　引经报使
　本草纲目序例第二卷
　　药名同异
　　相须相使相畏相恶诸药
　　相反诸药
　　服药食忌
　　妊娠禁忌
　　饮食禁忌
　　李东垣随证用药凡例
　　徐之才诸虚用药凡例
　　张子和汗吐下三法
　　病有八要六失六不治
　　药对岁物药品
　　神农本草经目录
　　宋本草旧目录
　本草纲目主治第三卷
　　诸风
　　痉风
　　项强
　　癫痫
　　卒厥
　　伤寒热病
　　瘟疫
　　暑
　　湿
　　火热
　　诸气
　　痰饮
　　脾胃
　　吞酸嘈杂
　　噎膈
　　反胃
　　呕吐
　　哕畹
　　呃逆
　　霍乱
　　泄泻
　　痢
　　疟
　　心下痞满
　　胀满
　　诸肿
　　黄疽
　　脚气
　　痿
　　转筋
　　喘逆
　　咳嗽
　　肺痿肺痈
　　虚损
　　瘵疰
　　邪祟
　　寒热
　　吐血衄血
　　齿衄
　　血汗
　　咳嗽血
　　诸汗
　　怔忡
　　健忘
　　惊悸
　　狂惑
　　烦躁
　　不眠
　　多眠
　　消渴
　　遗精梦泄
　　赤白浊
　　癃淋
　　溲数遗尿
　　小便血
　　阴痿
　　强中
　　囊痒
　　大便燥结
　　脱肛
　　痔漏
　　下血
　　瘀血
　　积聚癜瘕
　　诸虫
　　肠鸣
　　心腹痛
　　胁痛
　　腰痛
　　疝癀
　本草纲目主治第四卷
　　痛风
　　头痛
　　眩运
　　眼目
　　面
　　鼻
　　唇
　　口舌
　　咽喉
　　音声
　　牙齿
　　须发
　　胡臭
　　丹毒
　　风瘙疹痱
　　疬疡癜风
　　瘿瘤疣痣
　　瘰疬
　　九漏
　　痈疽
　　诸疮上
　　诸疮下
　　外伤诸疮
　　金、镞、竹、木伤
　　跌仆折伤
　　五绝
　　诸虫伤
　　诸兽伤
　　诸毒
　　蛊毒
　　诸物哽咽
　　妇人经水
　　带下
　　崩中漏下
　　胎前
　　产难
　　产后
　　阴病
　　小儿初生诸病
　　惊痫
　　诸疳
　　痘疮
　　小儿惊痫
　本草纲目水部第五卷
　　雨水（一）
　　潦水（二）
　　露水（三）
　　甘露（四）
　　甘露蜜（五）
　　明水（六）
　　冬霜（七）
　　腊雪（八）
　　雹（九）
　　夏冰（十）
　　神水（十一）
　　半天河（十二）
　　屋漏水（十三）
　　流水（十四）
　　井泉水（十五）
　　节气水（十六）
　　醴泉（十七）
　　玉井水（十八）
　　乳穴水（十九）
　　温汤（二十）
　　碧海水（二十一）
　　盐胆水（二十二）
　　阿井水（二十三）
　　山岩泉水（二十四）
　　古冢中水（二十五）
　　粮罂中水（二十六）
　　赤龙浴水（二十七）
　　车辙中水（二十八）
　　地浆（二十九）
　　热汤（三十）
　　生熟汤（三十一）
　　齑水（三十二）
　　浆水（三十三）
　　甑气水（三十四）
　　铜壶滴漏水（三十五）
　　三家洗碗水（三十六）
　　磨刀水（三十七）
　　浸蓝水（三十八）
　　猪槽中水（三十九）
　　市门溺坑水（四十）
　　洗手足水（四十一）
　　洗儿汤（四十二）
　　诸水有毒（四十三）
　本草纲目火部第六卷
　　阳火、阴火（四十四）
　　燧火（四十五）
　　桑柴火（四十六）
　　炭火（四十七）
　　芦火、竹火（四十八）
　　艾火（四十九）
　　附阳燧火珠
　　神针火（五十）
　　火针（五十一）
　　灯火（五十二）
　　灯花（五十三）
　　烛烬（五十四）　　
　本草纲目土部第七卷
　　白垩（五十五）
　　甘土（五十六）
　　赤土（五十七）
　　黄土（五十八）
　　东壁土（五十九）
　　太阳土（六十）
　　附执日天星上土执日六癸上土
　　二月上壬日土清明日戌上土
　　神后土
　　天子藉田三推犁下土（六十一）
　　附社稷坛土春牛土富家土
　　亭部中土
　　道中热土（六十二）
　　车辇土（六十三）
　　市门土（六十四）
　　户限下土（六十五）
　　千步峰（六十六）
　　鞋底下土（六十七）
　　柱下土（六十八）
　　床脚下土（六十九）
　　烧尸场上土（七十）
　　冢上土（七十一）
　　桑根下土（七十二）
　　胡燕窠土（七十三）
　　百舌窠中土（七十四）
　　土蜂窠（七十五）
　　蜣螂转丸（七十六）
　　鬼屎（七十七）
　　鼠壤土（七十八）
　　鼢鼠壤土（七十九）
　　屋内蠕下虫尘土（八十）
　　蚁垤土（八十一）
　　白蚁泥（八十二）
　　蚯蚓泥（八十三）
　　螺蛳泥（八十四）
　　白鳝泥（八十五）
　　猪槽上垢土（八十六）
　　犬尿泥（八十七）
　　驴尿泥（八十八）
　　尿坑泥（八十九）
　　粪坑底泥（九十）
　　檐溜下泥（九十一）
　　田中泥（九十二）
　　井底泥（九十三）
　　乌爹泥（九十四）
　　弹丸土（九十五）
　　自然灰（九十六）
　　伏龙肝（九十七）
　　土墼（九十八）
　　甘锅（九十九）
　　砂锅（一○○）
　　白瓷器（一○一）
　　乌古瓦（一○二）
　　古砖（一○三）
　　烟胶（一○四）
　　墨（一○五）
　　釜脐墨（一○六）
　　……
　本草纲目金石部第八卷
　本草纲目金石部第九卷
　本草纲目金石部第十卷
　本草纲目金石部第十一卷
　本草纲目草部第十二卷
　本草纲目草部第十三卷
　本草纲目草部第十四卷
　本草纲目草部第十五卷
　本草纲目草部第十六卷
　本草纲目草部第十七卷
　本草纲目草部第十八卷
　本草纲目草部第十九卷
　本草纲目草部第二十卷
　本草纲目草部第二十一卷
本草纲目下

本草纲目上
　　本草纲目主治第四卷
　　诸疮下
　　〔头疮〕菖蒲生涂。艾灰蓼子同鸡子白、蜜。镜面草同轻粉、麻油。鸡肠草烧灰，同盐。蒺藜苦参木耳蜜和。小麦烧傅。红曲嚼涂。胡麻嚼涂。糯饭人轻粉。豆油豆豉薄汁，和泥包烧，研涂。乌梅烧。杏仁烧。桃枭烧，入轻粉。槟榔磨粉。黄檗枳实烧研，同醋。肥皂烧，同轻粉、麻油。木芙蓉油和。乌桕根同雄黄。鬼齿烧，同轻粉。百草霜同轻粉。灶下土同十字道上土，等分。燕窠土同麝香。轻粉葱汁调。白矾半生半枯，酒调。雄黄皮鞋底煮烂涂。或烧灰，人轻粉。草鞋鼻灰尿桶上垢炒。蜂房灰脂和。蚕退纸灰人轻粉。蛇退灰同上。象肉灰。牛屎灰。五倍子同白芷。桑蛀屑同轻粉、麻油。地龙同轻粉。蜜蜂研涂。鲫鱼酿附子炙，和蒜研。或酿发灰。咸鱼油煎取滓。海螵蛸同轻粉、白胶香。鳖甲烧。甲香甲煎猪肾掺轻粉、五倍子，烧研。猪关髓人轻粉。熊脂并涂肥疮、烂疮。古松薄”皮小儿胎风头疮，人豉少许，炒研，人轻粉，香油调涂。榆白皮晒研，醋和绵上，贴头面疮，引虫。菟丝苗何首乌马齿并煎汤洗。桃花头上肥疮，为末水服。