在全球性水危机的情势下，流域国应采取包括生态补偿在内的多种方式来保护国际河流生态环境。但是，由于多重障碍的存在，国际河流生态补偿在实践中存在覆盖面窄、规模小等不足。要使生态补偿充分运用于国际河流，需要完善国际立法，确立生态受益方补偿原则；健全组织机构，在机构形式、组成及职能等方面进行变革；加强合作，明确各方在补偿中的权利及义务。同时，我国作为上游国，也必须采取积极的行动，以争取和保障我国在国际河流上的开发利用权及生态补偿获得权。