《水生动物微生态学》教材突出水生动物的主体特色，结合近年来水生动物在微生态学方面的研究进展，在介绍动物微生态学的原理的基础上，拓展水产动物的微生态的概念的内涵，尤其是水体养殖环境中微生物的作用，从而更加体现水生动物的特色。同时，强调微生态工程在水产养殖的中的重要作用，从水产微生态制剂的种类、调控技术、加工工艺等方面入手，展现水生动物微生态理论和技术在水产健康养殖的作用和地位。

目录
第一章 绪论 001
一、水生动物微生态学的概念与特点 001
二、微生态学的发展历史 003
三、微生态理论 007
四、微生态学分类及其与其他学科的关系 008
五、水生动物微生态学的作用与意义 009
第二章 水生动物微生态生理学与生态学基础 011
第一节 水生动物微生态空间与组织 011
第二节 微生态动力学 018
一、微生态演替的定义 019
二、微生态演替的过程 019
第三节 微生物与微生物间的关系 020
一、微生物种群内个体间的相互关系 020
二、微生物种群间的相互关系 021
第三章 水生动物正常微生物群及其生理功能 027
第一节 水生动物正常微生物群 027
一、水生动物正常微生物群的概念 027
二、水生动物正常微生物群的形成与组成 027
第二节 水生动物肠道菌群的营养功能 030
第三节 水生动物正常菌群的免疫防御功能 040
一、原籍菌群的免疫作用 041
二、外籍菌群的免疫作用 042
第四章 水生动物微生态的平衡与失调 044
第一节 水生动物微生态平衡的概念 044
第二节 水生动物微生态平衡的指标 045
一、水生动物微生态平衡的指标 046
二、水生动物微生态平衡的影响因素 046
第三节 水生动物微生态失调 047
一、水生动物微生态失调的概念 047
二、水生动物微生态失调的分类 048
三、水生动物微生态学的感染与微生态失调 049
四、水生动物微生态失调的因素 050
第五章 水生动物微生态学研究方法 051
第一节 水生动物微生态学常规研究方法 051
一、直接观察法 051
二、细菌培养法 053
三、微生物生物量测定法 055
四、基因工程 057
第二节 无菌斑马鱼培养方法 059
第三节 微生物组学研究方法 060
一、宏基因组学 060
二、宏转录组学 062
三、宏蛋白组学 063
四、整合宏组学 064
第六章 水产微生态工程与水产微生态制剂 065
第一节 水产微生态工程的概念 065
第二节 水产微生态制剂的种类与应用 066
一、乳酸菌 066
二、芽孢杆菌 067
三、酵母菌 068
四、光合细菌 069
五、硝化细菌与反硝化细菌 070
六、蛭弧菌 073
七、噬菌体 074
八、益生元 076
九、有益微生物菌制剂 077
第三节 水产微生态制剂的调控机制 078
一、水产微生态制剂与病害防治 078
二、水产微生态制剂与水质调节 083
三、水产微生态制剂与营养调控 087
第七章 水产微生态制剂生产工艺与储藏 091
第一节 水产微生态制剂液体生产工艺 092
一、好氧型水产微生态制剂的液体生产工艺 093
二、厌氧型水产微生态制剂的液体生产工艺 105
三、兼性厌氧型水产微生态制剂的液体生产工艺 112
第二节 水产微生态制剂固体生产工艺 116
一、喷雾干燥固体生产工艺 116
二、固态发酵工艺 118
三、浅盘固态发酵生产工艺 120
四、固态发酵罐生产工艺 122
第三节 发酵污染的预防和污染后的处理 124
一、发酵污染的预防 124
二、发酵污染后的处理 126
第四节 水产微生态制剂的储存 127
一、储存过程存在的问题 127
二、降低储存过程中活菌数衰减的方法 128
第八章 水产微生态制剂的安全性 130
第一节 安全性评价 130
一、水产微生态制剂 130
二、安全性的评价 130
第二节 安全性评价的内容和方法 131
一、安全性评价的内容 131
二、菌种的筛选与优化 134
三、安全性评价报告 134
主要参考文献 136
附录1 部分微生态制剂的介绍 141
附录2 中华人民共和国农业部公告第2045号——《饲料添加剂品种目录（2013）》 154
附录3 美国FDA公布的微生物饲料添加剂目录 155
附录4 对虾肠道菌群的宏基因组检测采样方法 157
附录5 无菌斑马鱼的饲养方法 158
附录6 《农业农村部关于加强水产养殖用投入品监管的通知》农渔发〔2021〕1号 161