本书内容广泛，包括了蛋白质内容及周围的基本相互作用、多肽链的二级结构、蛋白质的三级结构、蛋白质中的协同转变（变性与折叠）、蛋白质结构预测与设计以及蛋白质功能的物理基础等几个部分。其主旨是阐述蛋白质物理学的理论研究，即以物理学（特别是统计物理和热力学）的观点和方法来研究与蛋白质相关的物理学问题。本书循序渐进，深入浅出，以简明易懂的语言和简繁适当的数学估算对蛋白质相关的基础物理问题进行介绍，得出令人信服的结论。本书出版后被译为英文，在美、英、德等国多所大学采用为相关课程的教材。
本书是《海洋微生物学》（2007年）的新版。作为“十一五”国家重点规划图书，该书的第1版得到了广大同行和青年学生的厚爱，已成为广大高等院校和科研院所的首本“海洋微生物学”教材。目前，海洋微生物学已成为现代科学最重要的领域之一。近些年来，新方法和新技术在海洋领域的应用，进…+步推动了海洋微生物学科的迅速发展。为了紧随海洋微生物学快速发展的步伐，有必要对原有教材进行修订和提高。自《海洋微生物学》第1版出版以来，作者就开始对其中的内容进行更新和订正。经过8年多持续不断地修订，终于迎来了《海洋微生物学》第二版的面世。
《海洋微生物学》第二版在第1版的基础上，吸取各方面意见，主要在以6F几个方面进行了修订。
（1）更新内容。海洋微生物学是一门发展极为迅速的前沿学科。第二版除新增了“第7章深海和极地海洋微生物”和“第16章现代生物技术在海洋微生物研究中的应用”两个章节外，还参考国内外新文献和书籍并结合科研团队的研究成果对其他14个章节的内容进行了大幅度更新，增加了海洋微生物学领域的前沿技术和新研究成果。
（2）增加插图和复习题。图片由原来的69幅，增加到176幅，其中重要图片特别制成彩插附于书后.其他图片可以通过使用手机扫描封底二维码看到彩色版本，利于读者对许多典型实验现象的理解，使课本更加生动、有趣。此外，每一1章之后增加了复习题，便于学生对所学内容进行复习巩固。
（3）增强实践性。本书增加了实验操作内容，如“第14章海洋微生物的分离与培养技术”增加了海洋微生物分离培养的新方法及详细步骤，“第15章海洋细菌的分类与鉴定技术”全面阐明了海洋新菌分类和鉴定的详细过程及基本步骤。
（4）突出概念并提高可读性。针对在第1版教材使用过程中学生提出的建议，对教材中的概念进行了理顺，使概念更加突出。此外，书中语言的锤炼也从作者、审阅者、海洋微生物的初学者多个层面反复修改，力求增加可读性。
（5）专家逐章审阅。由于本教材为综合性教材，而每位专家所熟悉的领域不同，因此编者聘请各个研究方向的专家对书写内容逐章审阅，严格把关。
全书共分16章，第1章为海洋微生物学概论；第2～6章讲述海洋微生物的形态、结构及特性，包括海洋细菌、海洋古菌、海洋真核微生物和海洋病毒；第7章讲述深海和极地海洋微生物；第8章讲述海洋微生物在海洋生态系统中的作用；第9章讲述海洋环境中活的非可培养（VBNC）状态细菌；第10章讲述鱼类的微生物病害；第11章讲述海洋微生物的开发利用；第12～16章讲述海洋微生物的研究技术，包括海洋微生物的采样技术、海洋微生物的多样性研究技术、海洋微生物的分离与培养技术、海洋细菌的分类与鉴定技术，以及现代生物技术在海洋微生物研究中的应用。
本书初稿完成后，承蒙潍坊医学院赵乃昕教授（第1章、第3章、第15章）、中国科学院海洋研究所肖天研究员（第2章、第8章）、国家海洋局第三海洋研究所邵宗泽研究员（第3章）、国家海洋局第二海洋研究所许学伟研究员（第3章、第12章、第15章）、上海交通大学王风平教授（第4章）、同济大学张传伦教授（第4章）、天津科技大学孙军教授（第5章）、台湾海洋大学彭家礼教授（第5章）、中国海洋大学姜勇副教授（第5章）、中国海洋大学汪岷教授（第6章）、中国水产科学院黄海水产研究所史成银研究员（第6章）、中国水产科学院黄海水产研究所梁艳副研究员（第6章）、中国极地研究中心俞勇副研究员（第7章）、厦门大学张瑶教授（第8章）、兰州理工大学陈吉祥教授（第9章）、中国水产科学院黄海水产研究所莫照兰研究员（第10章）、中国海洋大学牟海津教授（第11章）、国家海洋局第1海洋研究所曲凌云研究员（第11章）、中国水产科学院黄海水产研究所李秋芬研究员（第13章）、山东大学威海分校杜宗军教授（第14章）、山东大学张熙颖副教授（第14章）、国家海洋局第三海洋研究所赖其良副研究员（第15章）、宁波大学张德民教授（第16章）给予审阅；在编写过程中还得到了国内外许多同仁的热心帮助，对他们的热心帮助深表谢意。
本书的部分研究内容和成果得到了国家自然科学基金项目（41276141、41476112和41521064）、科技部国际科技合作重点项目（2012DFG31990）、国家863计划项目（2012AA092103）、国家973计划项目（2013CB429700）和中国大洋协会国际海域资源调查与开发项目（DY125-15-R-03）的资助，本书的出版还获得了中国海洋大学教材出版基金的资助，编者在此‘并表示诚挚的感谢。
近些年来，海洋微生物学发展非常迅速，新知识、新技术和新方法不断出现，所涉及n勺内容存在多学科交叉问题。限于我们的知识和水平，书中不当之处在所难免，恳请读者和同行专家提出宝贵意见。
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第1章 海洋微生物学概论
1．1 海洋微生物及其研究意义
1．2 海洋微生物学的发展历程
1．3 海洋微生物的主要类群
1．4 海洋微生物的主要特征
1．5 海洋微生物的栖息环境
主要参考文献
复习思考题
第2章 海洋原核生物的结构及特性
2．1 海洋原核细胞的形态结构
2．2 海洋原核生物的营养及生长
2．3 海洋原核生物的能量产生过程
2．4 海洋细菌的密度感应和生物被膜
2．5 海洋原核生物的基因组学
主要参考文献
复习思考题
第3章 海洋细菌
3．1 细菌分类系统
3．2 海洋细菌的主要类群
3．3 产液菌门、热袍菌门和异常球菌-栖热菌门
3．4 绿弯菌门、硝化螺菌门和铁还原杆菌门
3．5 蓝细菌门和绿菌门
3．6 变形菌门
3．7 厚壁菌门和放线菌门
3．8 浮霉菌门、螺旋体门和酸杆菌门
3．9 拟杆菌门、疣微菌门、芽单胞菌门和黏胶球形菌门
主要参考文献
复习思考题
第4章 海洋古菌
4．1 古菌的分类系统
4．2 广域古菌门
4．3 泉生古菌门
4．4 奇古菌门
4．5 初生古菌门
4．6 纳米古菌门
4．7 其他古菌门类
4．8 古菌细胞膜脂及应用
主要参考文献
复习思考题
第5章 海洋真核微生物
5．1 真核微生物概述
5．2 原生动物
5．3 真核微藻
5．4 海洋真菌
主要参考文献
复习思考题
第6章 海洋病毒
6．1 海洋病毒的计数及形态观察
6．2 海洋病毒的产生和消亡
6．3 海洋病毒的多样性
6．4 海洋病毒对生物地球化学循环的影响
6．5 感染海洋生物的病毒
主要参考文献
复习思考题
第7章 深海和极地海洋微生物
7．1 深海微生物
7．2 极地微生物
7．3 海洋微生物的环境适应机制
主要参考文献
复习思考题
第8章 海洋微生物在生态系统中的作用
8．1 海洋食物网中的微食物环
8．2 海洋微生物在生物地球化学循环中的作用
8．3 海洋中微生物动态变化的控制因素
8．4 海洋微生物与环境变化
主要参考文献
复习思考题
第9章 海洋环境中活的非可培养（VBNC）状态细菌
9．1 VBNC状态细菌的发现及主要细菌类群
9．2 诱导细菌进入VBNC状态的环境因素
9．3 VBNC状态细菌的检测方法
9．4 VBNC状态细菌的生物学特性
9．5 细菌进入VBNC状态的内在机制
9．6 VBNC状态细菌的复苏研究
9．7 对细菌VBNC状态概念的争议
9．8 细菌VBNC状态的理论及实际意义
主要参考文献
复习思考题
第10章 鱼类的微生物病害
10．1 病害诊断
10．2 细菌性传染病
10．3 鱼类传染性病害的控制
主要参考文献
复习思考题
第11章 海洋微生物的开发利用
11．1 有益菌在海水养殖中的应用
11．2 海洋微生物产生的活性物质
11．3 海洋微生物的环境修复
11．4 海洋微生物与生物附着
11．5 海洋微生物的污损和防护
11．6 金属的微生物腐蚀及防护
11．7 微生物对木材的腐损及防护
11．8 海洋微生物的其他应用
主要参考文献
复习思考题
第12章 海洋微生物的采样技术
12．1 水样的采集
12．2 泥样的采集
12．3 检样的储存
12．4 海洋调查船
主要参考文献
复习思考题
第13章 海洋微生物的多样性研究技术
13．1 显微镜镜检计数法
13．2 培养计数法
13．3 流式细胞术
13．4 免疫学检测法
13．5 基于PCR的分子生态技术
13．6 荧光原位杂交技术
13．7 环境微生物组学技术
13．8 其他分子生物学技术
主要参考文献
复习思考题
第14章 海洋微生物的分离与培养技术
14．1 海洋异养细菌分离与培养的基础方法
14．2 特殊海洋异养细菌的分离培养
14．3 海洋化能自养菌的分离与培养
14．4 海洋光能营养菌的分离与培养
14．5 海洋古菌的分离与培养
14．6 海洋真菌的分离与培养
14．7 其他常见海洋微生物培养基配方
14．8 海洋微生物培养新技术
14．9 海洋微生物的保存方法
主要参考文献
复习思考题
第15章 海洋细菌的分类与鉴定技术
15．1 海洋细菌分类与鉴定的基本流程
15．2 形态特征分析方法
15．3 生理生化特征分析方法
15．4 化学特征分析方法
15．5 海洋细菌基因特征分析方法
15．6 细菌快速鉴定系统
15．7 海洋细菌新分类单元的命名及发表
15．8 展望
主要参考文献
复习思考题
第16章 现代生物技术在海洋微生物研究中的应用
16．1 转录组学技术及其应用
16．2 蛋白质组学技术及其应用
16．3 代谢组学技术及其应用
16．4 基因工程技术及应用
16．5 基因芯片技术及应用
16．6 基因敲除技术及应用
16．7 合成生物学技术及应用
16．8 基因调控技术及应用
16．9 蛋白质定向进化技术及应用
主要参考文献
复习思考题
名词索引
微生物中文名索引
微生物拉丁名索引
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