海洋是人类生存和发展的重要空间,海洋生物中蕴藏的基因资源是海洋生物资源可持续利用的核心和根本。《海洋生物功能基因开发与利用》系统介绍了基因资源的特征,我国近年来在海洋生物功能基因发掘与利用技术方面取得的重要成就,包括海洋生物功能基因发掘与验证及开发利用技术;相继完成的牡蛎、半滑舌鳎、海带等20余种海洋生物的全基因组测序及病原微生物、极地和其他海洋来源微生物功能基因的发掘与利用研究;建设中的基因资源共享平台及数据库,预测了今后的发展趋势。
《海洋生物功能基因开发与利用》旨在为从事海洋生物资源尤其是基因资源开发利用的科技人员、高等院校相关专业的师生及科技管理人员提供参考。
进入21世纪,随着人类基因组计划的完成和后基因组时代的到来,以基因技术为核心的生命科学与生物技术已成为自然科学和高新技术研究中最富有生命力的领域之一。生命科学的快速发展和关键技术的突破,启动了生物产业又一次新的革命,并进入了全球扩张阶段,其影响力远远超过前三次科技革命。现代生物技术正改变着人类的生活,成为解决人类粮食、健康和环境三大基本问题的关键技术,生物产业也将成为21世纪世界经济的支柱产业。生物资源是所有生命科学研究及生物技术产业的物质基础,随着对生物资源的进一步发掘和利用,基因资源的重要地位日益凸显,并必将继其他传统资源之后成为世界各国争夺的焦点。
海洋是人类生存和发展的重要空间,对世界各国经济社会可持续发展具有重要的战略意义。21世纪以来,海洋科技已进入世界科技竞争的前沿,并成为各国综合实力竞争的焦点之一。其中,发展海洋生物技术已成为新一轮生物科技革命的重要内容,海洋生物产业作为新世纪高新技术产业之一,正成为未来全球经济和社会发展的又一重要推动力。我国在“十二五”科技发展规划中将“发展海洋经济”列为优先主题,并在中国共产党第十八次全国代表大会上的报告中提出了“建设海洋强国”的战略方针,将发展海洋经济和海洋科技提升到前所未有的战略高度,也将海洋圈定为国家战略性新兴产业的主战场。我国海洋生物资源丰富,已鉴定的海洋生物有2万余种,海洋生物中蕴藏的基因资源是海洋生物资源可持续利用的核心和根本。面对数量巨大的海洋生物及其丰富的基因资源,发掘筛选出具有应用前景的功能基因,开发具有我国自主知识产权的海洋功能基因新产品,将催生以功能基因为源头的新兴生物工程产业。大力发掘和合理利用海洋生物基因资源,不仅能从更深层次探究海洋生命的奥秘,更是我国海洋资源可持续发展的必然趋势。面向国家战略需求和学科前沿,建立和发展功能基因发掘及开发利用技术是提高海洋生物资源发掘利用水平,提升蓝色经济核心科技创新力和国际竞争力,推动我国建设海洋强国步伐的必然之路。
丛书序
序言
前言
第一章 概述
第一节 基因与基因资源
一、基因的基本概念
二、基因资源的特性
三、功能基因的发掘利用
第二节 海洋生物功能基因与基因资源
一、海洋生物基因资源的特点
二、海洋生物基因资源研究现状
三、海洋生物功能基因开发利用
主要参考文献
第二章 海洋生物功能基因发掘与验证技术
第一节 基因组学技术
一、基因组调查
二、普通基因组图谱
三、复杂基因组图谱
第二节 转录组学技术
一、转录组技术平台
二、基于高通量测序的转录组学技术
三、转录组研究其他技术
四、单细胞转录组技术
五、非编码RNA研究技术
第三节 蛋白质组学技术
一、简介
二、研究进展及应用实例
三、展望及发展趋势
第四节 宏基因组学技术
一、宏基因组学起源
二、宏基因组学在海洋微生物研究中的应用
第五节 海洋生物功能基因验证技术
一、功能基因的结构特征分析与功能预测
二、基因表达规律分析技术
三、基于基因功能获得与失活策略的研究技术
四、基于基因编码产物与蛋白质或核酸相互作用的研究技术
主要参考文献
第三章 海洋生物功能基因开发利用技术
第一节 海洋生物基因功能产品——天然产物
一、简介
二、研究进展及应用实例
三、展望及趋势
第二节 海洋生物药用功能基因开发
一、概述
二、国内外研发现状与趋势
三、发展前景
第三节 海洋生物抗菌肽的研究与利用
一、简介
二、研究进展及应用实例
三、展望及趋势等
第四节 海洋生物基因功能产品——工业用品
一、概念、原理和技术
二、海洋生物基因工业产品的研究进展
三、展望
第五节 系统发育学及DNA条形码
一、系统发育学
二、DNA条形码
第六节 海洋环境污染监测技术及病原检测技术
一、海洋环境污染监测技术及病原检测技术简介
二、研究进展及应用实例
三、展望及趋势
主要参考文献
第四章 海洋动物功能基因的发掘和利用
第一节 海洋生物基因组进展
一、海洋鱼类
二、海洋鸟类
三、海洋爬行动物
四、海洋哺乳动物
五、其他海洋生物
六、总结与展望
第二节 半滑舌鳎
一、简介
二、半滑舌鳎基因组研究进展
三、半滑舌鳎重要性状相关功能基因发掘研究进展
第三节 牙鲆
一、简介
二、全基因组测序及精细图谱绘制研究进展
三、功能基因发掘利用研究进展及展望
第四节 石斑鱼
一、石斑鱼简介
二、斜带石斑鱼基因组研究进展
三、石斑鱼功能基因挖掘与利用研究进展
四、展望
第五节 弹涂鱼
一、弹涂鱼简介
二、弹涂鱼的两栖习性
三、弹涂鱼基因组学研究进展
四、弹涂鱼呼吸和体内离子平衡研究
五、弹涂鱼附肢的特化
六、总结与展望
第六节 大黄鱼
一、大黄鱼免疫系统特征
二、大黄鱼免疫相关基因研究
第七节 海马
一、海马简介
二、海马基因组及功能基因研究进展
三、海马功能基因研究展望
第八节 菊黄东方纯
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、功能基因发掘利用
第九节 中国明对虾
一、简介
二、中国明对虾功能基因及基因组研究进展
三、中国明对虾功能基因研究的应用前景
第十节 凡纳滨对虾
一、简介
二、凡纳滨对虾功能基因及基因组研究进展
三、凡纳滨对虾功能基因和基因组研究在生产中的应用
第十一节 牡蛎
一、牡蛎全基因组测序
二、生长发育基因与应用展望
三、贝壳形成相关功能基因与应用展望
四、牡蛎抗逆相关基因的筛选及应用前景
第十二节 扇贝
一、扇贝全基因组序列图谱组装及质量评估
二、扇贝基因组注释及结构特征分析
三、扇贝基因家族分析及比较基因组分析
四、扇贝胚胎发育基因表达模式
五、扇贝特殊适应性性状的遗传基础、调控机制及进化途径分析
第十三节 马氏珠母贝
一、简介
二、马氏珠母贝基因组的研究
三、以基因组为基础的功能基因研究
第十四节 鲍
一、物种简介
二、鲍功能基因研究进展
三、鲍转基因技术的初步研究
四、展望
第十五节 芋螺
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、芋螺毒素功能基因发掘利用
第十六节 芋螺转录组与芋螺毒素基因库建设
一、芋螺基因组调查测序分析
二、多种芋螺转录组测序分析
主要参考文献
第五章 海洋植物功能基因的发掘和利用
第一节 海洋植物基因组及功能基因研究进展
一、我国红藻栽培及分子生物学研究现状
二、我国绿潮原因种——浒苔及功能基因研究现状
三、我国褐藻栽培及分子生物学研究状况
四、海洋微藻的研究与利用
五、总结与展望
第二节 褐藻
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、功能基因发掘利用
第三节 紫菜
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、紫菜功能基因相关研究及发掘利用
第四节 江蓠
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、功能基因发掘利用
第五节 微藻
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、微藻功能基因的利用
主要参考文献
第六章 海洋微生物功能基因的发掘和利用
第一节 对虾白斑综合征病毒
一、WSSV基因组研究
二、WSSV结构蛋白研究
三、WSSV极早期基因研究
第二节 迟缓爱德华菌
一、迟缓爱德华菌简介
二、迟缓爱德华菌基因组
三、迟缓爱德华菌基因功能研究
四、基于迟缓爱德华菌毒力功能基因的相关疫苗设计
第三节 其他海洋微生物
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、功能基因发掘利用
第四节 极端环境微生物
一、简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、功能基因发掘利用
主要参考文献
第七章 其他海洋生物功能基因的发掘和利用
第一节 单环刺蜢
一、种类概况简介
二、基因组及功能基因研究进展
三、功能基因应用研究
第二节 绿海龟
一、绿海龟和中华鳖简介
二、绿海龟和中华鳖基因组的测序及组装
三、结果与分析
四、总结
第三节 小须鲸
一、物种简介
二、基因组工作
三、重要功能基因
主要参考文献
第八章 海洋生物基因资源共享及数据库建设
第一节 海洋生物基因资源共享办法
一、总则
二、共享海洋生物基因数据资源的保存原则及方式
三、海洋生物基因资源共享原则及方式
四、海洋生物基因资源保存及共享各方责权
五、管理机构及职能
第二节 千种鱼类转录组计划
第三节 国际水生哺乳动物基因组计划
第四节 深圳国家基因库的数据库建设与应用
一、简介
二、国家基因库数据库建设
三、国家基因库数据库应用实例
四、生物信息数据库建设的探讨
主要参考文献