《百部丛书增编》在《丛书集成初编》原有体例基础上，继踵其编辑精神，以清代辑印丛书以及1949年以前的著作为主，间收小部分明代丛书，总计176部。除按《丛书集成初编》原有编辑体例，收入普通丛书（61部）、专科丛书（40部）、地方丛书（14部）以外，增收“氏族与独撰类丛书”61部，以补《丛书集成初编》《丛书集成续编》不足。

并且淘汰其中重复，以及《丛书集成初编》、《丛书集成续编》（上海书店出版社）已收录者，实存6000余种图书 总数约20000多卷。以种数言，已超过《四库全书》著录百分之七十几；以卷数言，也在《四库全书》著录将近百分之三十。全书采取原书影印方式，初无几尘落叶之劳，坐收存古益今之功，乾嘉之儒，纵毕生经营，亦未见能有此成果。