本书是面向高等医药院校开展信息处理与分析教学活动设计的教材。本书以培养学生的信息获取能力,分析与利用能力为目标,全面阐述了医药科研活动中所运用到的信息科学基本方法、技术,工具。全书共5章,主要包括信息处理与分析的内涵及相关技术,医药信息处理与分析的基本流程,医药信息分析质量保证的几个关键因素,医药信息采集与预处理,医药信息分析方法和工具,医药信息处理与分析案例,医药信息标准。
(1)注重领域特色、组织结构合理
该书以医药信息为主线来组织素材,将信息处理技术与信息分析方法有机融合。全书采用总分式结构进行阐述:绪论中呈现了信息处理与分析的基本流程,使读者从宏观了解信息处理与分析每一步骤,进而激发读者深入学习的兴趣,以掌握信息处理与分析的每一阶段的关键技术与方法;紧紧围绕绪论,其它章节从内容上将信息处理与分析的每一环节有序贯通,使读者在学习时对各章节的内容一目了然,并能有的放矢,达到事半功倍的学习效果。
(2)选材经典、注重理论与实践的结合
本书的素材来自多年的教学积淀,选取了经典、有代表性的信息处理与分析的技术、工具与方法,列举了大量的医药信息处理案例分析,同时每章还配有难度适当的练习,使得理论知识与实践操作有机结合在一起,做到正真意义上的学以致用。
(3)引导思维、促进学科交叉
通过介绍医药信息处理技术以及信息分析方法和工具,使学生能够从信息科学的角度对医药科学研究工作中的问题进行思考与分析,以解决跨学科间交流、合作带来的鸿沟,从而促进多学科交叉合作的协同研究。
晏峻峰,湖南中医药大学博士、教授,长期从事中医药信息技术处理与分析的教学与科研工作,具有丰富的教学与实践经验,主编了多本信息技术教材。
第1章 绪论 1
1.1 信息的概念及相关知识 1
1.1.1 信息的概念 1
1.1.2 信息的基本特征 2
1.1.3 信息、数据与知识的关系 3
1.2 信息处理与分析的内涵及相关技术 4
1.2.1 信息处理的内涵 4
1.2.2 信息分析的内涵 5
1.2.3 信息论及相关常识 5
1.3 医药信息与医药信息学 7
1.3.1 医药信息 7
1.3.2 医药信息学 9
1.4 医药信息处理与分析的基本流程 9
1.5 医药信息分析质量保证的几个关键因素 10
本章小结 12
本章习题 12
本章参考文献 12
第2章 医药信息采集与预处理 13
2.1 医药信息资源的获取与处理 13
2.1.1 文献信息资源的获取与处理 13
2.1.2 临床信息资源的获取与处理 40
2.1.3 实验数据资源的获取与处理 44
2.2 数据预处理的基本方法 45
2.2.1 数据清理 45
2.2.2 数据集成 46
2.2.3 数据变换 46
2.2.4 数据规约 47
2.3 医药信息管理及相关技术 47
2.3.1 文献信息管理 48
2.3.2 数据管理 61
本章小结 62
本章习题 63
本章参考文献 63
第3章 医药信息分析方法和工具 64
3.1 医药信息分析方法 64
3.1.1 医药信息分析的目的 65
3.1.2 医药信息分析内容的分类 65
3.1.3 医药信息分析方法的分类 65
3.1.4 构建分析体系的原则 66
3.2 常用信息分析工具 67
3.2.1 SAS统计软件 67
3.2.2 SPSS统计软件 67
3.2.3 MATLAB 68
3.2.4 R语言 68
3.2.5 Excel 68
3.3 MATLAB工具 69
3.3.1 MATLAB简介 69
3.3.2 MATLAB的编程基础 78
3.3.3 MATLAB的矩阵运算 82
3.3.4 MATLAB程序设计 90
3.3.5 MATLAB绘图基础 96
本章小结 107
本章附录 常用MATLAB函数的使用方法 108
本章习题 115
本章参考文献 116
第4章 医药信息处理与分析案例 118
4.1 多元线性回归分析 118
4.1.1 多元线性回归分析的基本思想 118
4.1.2 多元线性回归分析的求解过程 119
4.1.3 多元线性回归分析实例解析 120
4.2 主成分分析 122
4.2.1 主成分分析的基本思想 123
4.2.2 主成分分析的求解过程 123
4.2.3 主成分分析实例解析 126
4.3 聚类分析 128
4.3.1 聚类分析的基本思想 128
4.3.2 系统聚类 129
4.3.3 K-means聚类 133
4.4 判别分析 138
4.4.1 判别分析的基本思想 138
4.4.2 判别分析的求解过程 139
4.4.3 判别分析实例解析 140
4.5 决策树分析 141
4.5.1 决策树的基本概念 142
4.5.2 相关算法 143
4.5.3 决策树的修剪 145
4.5.4 决策树在医院患者分析中的应用 147
4.6 支持向量机算法 150
4.6.1 基本思想 150
4.6.2 线性SVM的求解过程 153
4.6.3 其他类型的支持向量机 154
4.6.4 MATLAB的SVM函数使用 154
4.6.5 支持向量机算法实例解析 154
4.7 贝叶斯分类算法 155
4.7.1 基本思想 156
4.7.2 求解过程 157
4.7.3 实例解析 158
4.8 时间序列分析 159
4.8.1 原理 159
4.8.2 时间序列分析的实例分析 160
4.8.3 确定性时间序列分析案例 160
本章小结 165
本章函数详细说明 166
本章习题 173
本章参考文献 176
第5章 医药信息标准 177
5.1 常用医药信息标准介绍 177
5.1.1 标准的概念 177
5.1.2 标准化的概念 180
5.1.3 标准与标准化的关系 181
5.1.4 信息标准化 182
5.1.5 国际标准化机构和组织 182
5.1.6 医学信息标准 183
5.1.7 医学信息交换标准 184
5.2 医学信息分类与编码 186
5.2.1 分类 186
5.2.2 编码 187
5.2.3 医学信息分类与编码的方法 187
5.3 医药信息处理与分析中应用标准的原则 188
本章小结 188
本章习题 188
本章参考文献 189